杭长客专全线共设杭州东、杭州南、诸暨、义乌、金华西、龙游南、衢州、江山、玉山南、上饶、弋阳东、鹰潭北、东乡北、进贤南、南昌西、高安、新余北、宜春东、萍乡北、醴陵北、新长沙共21个车站。
21个站点跨越浙江江西湖南：
杭长客专东起杭州，西至湖南长沙，线路穿越浙江、江西、湖南三省，途经杭州、南昌、长沙三个省会和金华、衢州、上饶、鹰潭、新余、宜春、萍乡7个地级市以及浙江绍兴、江西抚州、湖南株洲三个地级市所辖部分区县。
在浙江省境内，杭长高铁线路走向大体上与既有浙赣铁路平行。线路自杭州东站引出，利用在建的钱塘江铁路新桥至杭州南站，途经浙江境内的7个站点(分别为：杭州南、诸暨、义乌、金华西、龙游南、衢州、江山)，沿既有铁路南行，然后线路向西至江西省。
杭长高铁东起杭州东站，西至长沙南站，全线设杭州东站、杭州南站、诸暨站、义乌站、金华站、龙游站、衢州站、江山站、玉山南站、上饶站、弋阳站、鹰潭北站、抚州东站、进贤南站、南昌西站、高安站、新余北站、宜春站、萍乡北站、醴陵北站、长沙南站等21个车站。
