截至2021年查询，舟山机场的直飞航班有：深圳、连云港、上海、北京、厦门、重庆、南昌、福州、大连、烟台、济南、泉州、青岛（数据统计于2019年）。
舟山机场飞行等级为4D级，飞行区跑道长2500米，停机坪总面积为9.6万平方米，设有14个机位，能满足波音757及以下的机型起降；国内候机楼面积6400平方米，可满足高峰小时客流量600人次，实际年吞吐旅客能力可达80万人次；机场配套的航行气象、通信导航、供电供油、机务维修、消防保安、安全检查等各类设施、设备和车辆。
舟山普陀山机场通航国内20个城市：北京、天津、哈尔滨、济南、青岛、西安、郑州、连云港、福州、厦门、泉州、温州、上海、长沙、黄山、南昌、武汉、深圳、揭阳、衢州。
但受近期客流影响，普陀山机场计划性取消了大部分航班
