厦门市博物馆于1983年筹建，1988年正式对外开放，旧馆原址位于鼓浪屿的八卦楼。
2006年厦门市郑成功纪念馆、厦门市文化遗产保护中心并入厦门市博物馆，2007年新馆迁至位于厦门市思明区体育路95号的厦门文化艺术中心，比原馆大了6倍。如今的厦门市博物馆由厦门博物馆主馆、郑成功纪念馆、厦门经济特区纪念馆、厦门市文化遗产保护中心、思明破狱斗争陈列馆、陈化成纪念馆、陈胜元故居七个部分组成，是一座地方综合性博物馆。
陈列室分块展示了厦门的历史建制沿革、港口建立与城市发展、历史名人与近现代英雄志士。在这里可以看到很多厦门地区有名的历史文化名人，如：陈黯、保生大帝、苏颂、朱熹、郑成功、陈化成等等。闽台民俗馆的展厅共有五个，以春夏秋冬的四季岁时节俗作为主干，通过陈列150余件近代民间文物，呈现了包括婚丧冠祭、衣食住行、耕作渔获、商旅经贸以及民间信仰等诸多富有特色的闽南文化风俗。
厦门奥林匹克博物馆
厦门奥林匹克博物馆是由国际奥委会和中国奥委会批准成立的中国第一家奥林匹克专题博物馆，是国际奥林匹克博物馆联盟22家成员之一。博物馆由国际奥委会委员、著名建筑专家吴经国先生筹划创建，并亲任馆长。馆内收藏了丰富的奥运会相关文物，旨在薪传奥林匹克文化，让更多的人了解、感受和分享奥运精神。
博物馆呈开放结构，主体建筑分上下两层，一层大厅为公共区域，配有多媒体报告厅、VIP会议室、咖啡休闲厅及可经营国际奥林匹克和历届奥运题材的特色纪念品商店；二层由一个序厅和四个展厅组成，大部分展品为吴经国先生担任国际奥委会委员20年来个人收藏的奥林匹克相关文物及纪念品，包括奥运火炬、奖牌、邮票、徽章、纪念币、吉祥物等共计11000余件。
厦门大学人类学博物馆
厦门大学人类博物馆是联合国教科文组织认定的著名博物馆，也是中国大陆唯一的一所人类学专科博物馆，是中国人类学、考古学、民族学专科性博物馆。陈列分人类的起源和发展、文化的起源和发展、中外民族文物 3部分。
馆内所藏的中国东南地域史前遗物是一大特色，形形色色的早期闽台地区文物，反映了中国大陆东南部文化和台湾文化、南洋文化的渊源关系。以及人类的发展铜像，展示了人类文明的进展。
华侨博物馆
厦门市华侨博物院，是以华侨华人历史为主题，集文物收藏、陈列展览、学术研究为一体的文化教育机构。由著名华侨领袖陈嘉庚先生主持创办，并由侨胞和归侨捐款筹建， 1959年5月正式开放。华侨博物院被著名的英籍女作家韩素英誉为“世界上独一无二的华侨历史博物馆”。
现有文物及自然标本等收藏品6000多件，包括历代陶瓷器、青铜器、古钱币、古字画、古代雕刻工艺品、外国工艺品、陶瓷玻璃皿、字画和动物标本等，其中有多件国家一级文物，这些藏品分期分批在文物馆和自然馆展出，其中有许多珍品是陈嘉庚先生当年为华侨博物院而搜集珍藏的。
鼓浪屿钢琴博物馆
鼓浪屿钢琴博物馆于2000年1月落成，位于福建省厦门市鼓浪屿景区菽庄花园的“听涛轩”，占地450平方米。分上下两层，两座管楼，博物馆里陈列了爱国华侨胡友义收藏的40多架古钢琴，其中有稀世名贵的镏金钢琴，有世界最早的四角钢琴和最早最大的立式钢琴，有古老的手摇钢琴、有产自一百年前的脚踏自动演奏钢琴和八个脚踏的古钢琴等。
鼓浪屿风琴博物馆
风琴博物馆是目前国内唯一、世界最大的风琴博物馆。与在东南部菽庄花园的钢琴博物馆交相辉映，让全世界的音乐爱好都能怀着朝圣的心情来到这座有着无以伦比的美丽的音乐之岛。馆内收藏有多种款式的风琴，大的有6米高的诺曼·比尔管风琴，小的只有手提箱一般大小，但麻雀虽小五脏俱全。
除了目前馆内的30多件珍贵藏品外，胡友义先生计划把一批电子风琴、数字琴和电影院管风琴等古风琴珍品运抵八卦楼，充实博物馆的藏品量。
鼓浪屿国际刻字艺术馆
鼓浪屿国际刻字艺术馆设在位于菽庄花园对面一幢面积约500多平方米的观海小楼内，2008年才正式开馆，一层被辟为国际展厅，二层为中国展厅。是目前国际上唯一一家大规模、高档次的国际刻字艺术展览馆。
馆内珍藏有中国、日本、韩国、新加坡、马来西亚五个国家的407件作品，这些作品大多是2004年第五届全国刻字艺术展和第八届国际刻字艺术展的入选作品，代表了国际国内最高的刻字艺术水准。
厦门市博物馆于1983年筹建，1988年正式对外开放，旧馆原址位于鼓浪屿的八卦楼。2006年6月，经中共厦门市委机构编制委员会批准，将厦门市郑成功纪念馆、厦门市文化遗产保护中心并入厦门市博物馆，如今的厦门市博物馆由厦门博物馆主馆、郑成功纪念馆、厦门经济特区纪念馆、厦门市文化遗产保护中心、思明破狱斗争陈列馆、陈化成纪念馆、陈胜元故居七个部分组成，为全民所有制事业单位，隶属厦门市文化局管理，是一座地方综合性博物馆。2007年新馆迁至位于厦门市思明区体育路95号的厦门文化艺术中心，新馆建筑面积25300平方米，展厅面积9597平方米，库房面积2800平方米，新馆较之旧馆建筑面积扩大6倍。厦门市博物馆还致力于闽台两岸及传世珍贵文物的收藏、保护、研究、陈列，利用博物馆直观的展品，宣传文物政策，普及文物知识，弘扬中华民族的传统文化，进行爱国主义教育。
