扬州东站和西站区别为：位置不同、通行车辆不同、管辖公司不同。
一、位置不同
1、扬州东站：扬州东站位于江苏省扬州市邗江区城北乡瓦窑村。
2、扬州西站：扬州西站座落于扬州市文昌西路530号。
二、通行车辆不同
1、扬州东站：扬州东站是扬州火车货运站，本站没有客运安排，只接受货物运输。
2、扬州西站：扬州西站是扬州汽车客运站。
三、管辖公司不同
1、扬州东站：扬州东站隶属中国铁路上海局集团有限公司（原上海铁路局）管辖。
2、扬州西站：扬州西站为江苏扬汽集团所属二级单位，由江苏扬汽集团管辖。
参考资料来源：
百度百科——扬州东站
百度百科——扬州汽车客运站
扬州站是扬州西站。扬州西站是扬州汽车客运站，也叫西部交通客运枢纽，亦称扬州汽车西站、扬州汽车总站，为江苏扬汽集团所属二级单位。现座落于扬州市文昌西路530号，毗邻扬州火车站，是交通部核定的一级汽车客运站。扬州站，位于中国江苏省扬州市邗江区，是由中国铁路上海局集团有限公司管辖的二等站，为宁启铁路的中间站。扬州站于2003年开工建设，2004年3月建成。2004年4月18日，扬州站正式投入使用。2016年5月，扬州站正式开行动车组列车。截至2016年5月，扬州站建筑面积20240.8平方米，站场规模为3台7线。
