1950年，全国除台湾外，设立26个海关，9个分关和35个支关共70个海关机构。至1984年底，全国设有海关40个，分关34个，支关43个，共117个海关机构，分布在22个省、市、自治区。上述海关及其分支机构，散处于我国的辽阔边境和沿海港口，各又各有特点。
海关的职责是促进贸易便利化，打击走私，征收关税，管理贸易政策，保障公平贸易及其他国际公约、协定得到全面实施。海关任务是保持关税增长，为贸易及旅客进出提供便利，促进海关把关能力及竞争力的提升，增进守法、打击非法贸易，保障各海关业务现场及供应链的安全。
海关组织机构如下：
1、人力资源处。负责通过实施能力建设相关项目，全面提高海关全体关员履行职权的能力，并在员工绩效基础上营造内部合作氛围；
2、财务处。负责制定、实施并管理所有与财务相关的政策与事务。包括制定、管控财务目标，为各部门制定年度预算；
3、行政事务处。负责为员工提供最高效的工作环境。对各部门采购及项目执行情况进行监督。通过资产管理，对海关财政预算外资金进行管理。
《中华人民共和国海关法》第三条 国务院设立海关总署，统一管理全国海关。
国家在对外开放的口岸和海关监管业务集中的地点设立海关。海关的隶属关系，不受行政区划的限制。
海关依法独立行使职权，向海关总署负责。
中国直属海关在广东分署，天津、上海等全国31个省、自治区、直辖市。直属海关是指直接由海关总署领导，负责管理一定区域范围内海关业务的海关。目前我国共有42个直属海关，除香港、澳门、台湾地区外，分布在全国31个省、自治区、直辖市。直属海关就本关区内的海关事务独立行使职权，向海关总署负责。直属海关承担着在关区内组织开展海关各项业务和关区集中审单作业，全面有效地贯彻执行海关各项政策、法律、法规、管理制度和作业规范的重要职责，在海关三级业务职能管理中发挥着承上启下的作用。
海关总署是中国海关的领导机关，是中华人民共和国国务院下属的正部级直属机构，统一管理全国海关。海关总署机关内设15个部门，并管理6个直属事业单位、4个社会团体和3个驻外机构。中央纪委监察部在海关总署派驻纪检组监察局。中华人民共和国海关是国家的进出境监督管理机关，实行垂直管理体制，在组织机构上分为3个层次：
第一层次是海关总署；
内设21个司局，包括关税司、政法司、办公厅、监管司、缉私局，还有一个厅局级的事业单位，如海关出版社、服务中心、信息中心、数据中心等等。
第二层次是广东分署，天津、上海2个特派员办事处，41个直属海关和2所海关学校；
全国各省、市、自治区都设有直属海关，其中广东省有7个直属海关，福建、内蒙古、辽宁、浙江都有2个直属海关。
山东的济南海关和江苏的苏州海关想独立，结果没有独立了，现在分别受青岛海关和南京海关管辖。
2所海关学校是上海高等专科学校和秦皇岛海关培训学校。
第三层次是各直属海关下辖的562个隶属海关机构。
此外，在布鲁塞尔、莫斯科、华盛顿以及香港等地设有派驻机构。中国海关现有关员（含海关缉私警察）48000余人
