额济纳旗位于内蒙古自治区最西端,东南与阿拉善右旗相连,西和西南与甘肃省毗邻,北与蒙古国接壤,边境线长507公里。额济纳旗地形由西南向东北逐渐倾斜,呈四周高,中间低平状,海拔高度在898米—1598米之间。地貌主要由戈壁、低山、沙漠、河流、湖泊和绿洲等构成。
发源于青海省祁连山北麓的黑河(古称弱水、上中游称黑河、入旗境称额济纳河)是额济纳的母亲河,由南向北,经甘肃省张掖、高台、金塔等市县入旗,至巴彦宝格德(狼心山)分为东、西两条河,向北又分为19条支流,最后汇入东、西居延海,形成3.16万平方公里的额济纳绿洲。
额济纳旗是以蒙古族为主体的少数民族中蒙边境旗,位于内蒙古自治区最西端。地处内蒙古西北边陲,是世界上仅存的三大胡杨林区之一。 额济纳交通,一条路是从内蒙古呼和浩特出发,经阿拉善旗乘长途车进入。另一条路是乘飞机到兰州,再乘火车到酒泉,转每天一班的长途车。前往额济纳,最好集体租班车,额济纳属边防地区,必须在当地办理好边防通行证方可进入。