单顺反子是真核生物基因转录产物；多顺反子是指一个mRNA分子编码多个多肽链。通常的表述就是顺反子就是一个基因，单顺反子和多顺反子是基因转录产物,他们是顺反子DNA复制后得到的,并不是顺反子的分类。当我们提及顺反子的时候,按照一个基因来说,但是当你对于原核生物多条基因共同编译一个多肽时候,就不能说顺反子了,要称之为多顺反子。
因为以上情况,提出多顺反子概念,从而使得在mRNA层次上需要区分单,多顺反子，而基因本身的顺反子并不需要区分,从而就造成了以上差异。
单顺反子和多顺反子的区别：
1.编码数量不同
单顺反子编码一个基因片段；多顺反子编码多个多肽链。
2.所拥有起点和终点不同
单顺反子的一条mRNA模板只含有一个翻译起始点和一个终止点；多顺反子对应的DNA片段则位于同一转录单位内，各自拥有起点和终点。
3.生物类别不同
原核生物mRNA常以多顺反子（见）的形式存在；真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在。
单顺反子：真核生物基因转录产物。多顺反子：指一个mRNA分子编码多个多肽链。
顺反子（cistron）即结构基因，为决定一条多肽链合成的功能单位，顺反子的概念来自遗传学中的顺反重组试验，是确定交换片段究竟在一个基因内还是属于两个基因的试验，简言之，一个顺反子就是一个基因，多顺反子就是多个基因。
注意：
原核生物mRNA一般5'端有一段不翻译区，称前导顺序，3'端有一段不翻译区，中间是蛋白质的编码区，一般编码几种蛋白质。如大肠杆菌乳糖操纵子mRNA编码3条多肽链色氨酸操纵子mRNA编码5条多肽链。
也有单顺反子形式的细菌mRNA，如大肠杆菌脂蛋白mRNA。原核生物mRNA分子中一般没有修饰核苷酸，也没有5'端帽子结构和3'端聚腺苷酸尾巴。原核生物mRNA的编码区一般编码几种功能上相关联的蛋白质，两种蛋白质的编码区之间常有一小段不翻译的顺序，叫做间隔区。
