工程菌是采用现代生物工程技术加工出来的新型微生物，具有多功能、高效和适应性强等特点。
所谓工程菌就是采用生物工程技术将多种微生物的降解性基因从细菌中取出，然后组装到一个细胞中，使这个菌株集多种微生物的降解性功能于一身，同时可以降解多种化合物。因此，工程菌具有多种功能，所以适应性也强；同时克服了混合微生物之间的相互制约，大大提高了对污水的降解效率。工程菌适用于化工污水，制药污水、印染污水等多种污水的处理。
RNA。基因工程菌顾名思义就是通过基因工程改造过遗传物质的菌株，由于其RNA的遗传物资导致其可以遗传给下一代，这样的菌株的生物性状更加适合工业生产应用，比如产量更高，产物更纯，生产成本更低等等。
