包括几种,RNase A和RNase H
RNase H是一种核糖核酸内切酶,它能够特异性地水解杂交到DNA链上的RNA磷酸二酯键,故能分解RNA/DNA杂交体系中的RNA链.该酶不能消化单链或双链DNA.
RNase A是一种被详细研究和具有广泛应用的核酸内切酶.RNase A 对RNA有水解作用,但对DNA则不起作用.RNase A在C端和U端残基处专一地催化RNA的核糖部分3'-与5' -磷酸二酯键的裂开,形成具有 2',3'-环磷酸衍生物寡聚核苷酸.可以用来去除DNA制品中的污染RNA.
指能水解RNA磷酸二酯键的酶称核糖核酸酶（ribonuclease，RNAse）。不同的RNAse其专一性不同，例如牛胰核糖核酸酶（RNAse I）。
它的作用位点是嘧啶核苷3’一磷酸与其他核苷酸之间的连接键，而核糖核酸酶T1（RNAse T1）的作用位点是3’鸟苷酸与其他相邻核酸之间的5’一OH间的连键。
核糖核酸酶A的主要用途为
1、从DNA：RNA杂交体中去除未杂交的RNA区。
2、确定RNA或DNA中的单碱基突变的位置。在RNA：DNA或RNA：RNA杂交体中，若存在单碱基错配，可用RNAse A识别并切割。通过凝胶电泳分析切割产物的大小，即可确定错配的位嚣。
3、RNA检测。RNA酶保护分析法（RNAse protection assay）是近年来发展起来的一种检测RNA的杂交技术。
其基本原理是利用单链RNA探针，与待测的RNA样品进行杂交形成RNA：RNA双链分子，由于RNA酶可专一性地降解未杂交的单链RNA，而双链受到保护不被降解，经凝胶电泳可以确定目的RNA的长度。
该方法灵敏度较Northern杂交法更高，并可进行较为准确的定量。选择适当的探针，还可进行基因转录起始位点分析及内含子（也称内元）剪切位点分析等研究。此法的灵敏度比核酸酶S1保护分析法高数倍。
4、降解DNA制备物中的RNA分子。须使用无DNAsd的RNAse（DNase I free RNAse），市售的一般RNAse A常含有DNAse，可在100 retool/I Tris—CI（pH 7．5）和15 mmol/l。NaCI溶液中100℃加热15 min，以去除之。
