正交和反交：正交和反交自由定义。若甲为母本，乙为父本间的交配方式称为正交，则以甲为父本，乙为母本的交配方式称为反交。可用正交和反交确定某遗传是细胞质遗传还是细胞核遗传。
自交：同一植物体有性交配（包括自花传粉和同株的异花传粉）。
测交：F1或其他生物体与隐形个体交配，可用确定被测个体的基因型或遗传方式。
1、正交和反交基因型不同的两种个体甲和乙杂交，如果将甲作父本，乙作母本定为正交，那么以乙作父本，甲作母本为反交；反之，若乙作父本，甲作母本为正交，则甲作父本，乙作母本为反交。在实践中，正反交常用于判断某性状的遗传方式是细胞核遗传还是细胞质遗传，在细胞核遗传中，也可利用正反交判断是常染色体遗传还是伴性遗传。具有相对性状的两个亲本杂交，若正交和反交的子代性状表现相同，则该性状属于细胞核遗传，由常染色体上的等位基因控制，例如高茎豌豆和矮茎豌豆杂交，正交和反交F1均为高茎；若正交和反交的结果不同，子代性状在雌雄性中的比例并不都是1:1，表现出交叉遗传的特点则该性状属于细胞核遗传，由X染色体上的等位基因控制，例如红眼果蝇和白眼果蝇正反交。
2、测交的定义是孟德尔在验证自己对性状分离现象的解释是否正确时提出的，为了确定F1是杂合子还是纯合子，让F1代与隐性纯合子杂交，这就叫测交。但有时候即使已知某个个体是杂合子，该杂合子与隐性纯合子的交配也叫测交。同时教材上孟德尔在验证对两对性状重组现象的解释时，让F1与双隐个体进行测交，不少学生就误以为在研究两对相对性状时，只有亲本组合是双杂和双隐时，才叫测交，其实任何遗传规律都源于先对一对相对性状的观察。观察两对性状的遗传规律时，都是先单独观察的，所以只要保证每对性状都是测交，整个组合就是测交。
3、自交是闭花授粉、自花授粉或同株授粉的植物的主要交配方式，如豌豆，玉米等。雌雄异株但基因型相同的植株之间交配也叫自交，但基因型相同的动物个体之间的交配一般不叫自交，通常称之为自由交配。在实践中，自交主要用于鉴定某对相对性状的遗传是否遵循基因的分离定律，也可用于鉴定某种显性植株的基因型，若该个体自交，在子代数量足够多的情况下，子代出现性状分离，则该个体为杂合子，若子代不出现性状分离，则为纯合子。同时在杂交育种中，连续自交是获取能稳定遗传的纯种的主要方法。
