载体蛋白相当于结合在细胞膜上的酶，有特异性结合位点，可与底物（溶质）发生暂时的、可逆性的结合和分离，且一种特异性载体只转运一种类型的分子或离子。物质的转运过程类似于酶与底物作用的饱和动力学曲线，既可以被底物类似物竞争性抑制，又可以被痕量的某种成分（抑制剂）非竞争性抑制以及对pH有依赖性等。因此有人将载体蛋白称为通透酶，与酶不同的是载体蛋白可以改变过程的平衡点，加快物质沿着自由能减少的方向跨膜运输的速率；此外与酶的不同是载体蛋白对转运的溶质不做任何共价修饰。
通道蛋白是一类跨越细胞膜双分子层的蛋白质,它所介导的被动运输不需要溶质分子与其结合，而是横跨膜形成亲水通道，允许大小适宜的分子和带电离子通过。通道蛋白可以是单体蛋白，也可以是多亚基组成的蛋白，它们都是通过疏水的氨基酸链进行重排，形成水性通道。某些通道蛋白在革兰氏阴性细菌的外膜、线粒体或叶绿体的外膜上形非选择性的通道。绝大多数的通道蛋白形成有选择性开关的多次跨膜通道。这些通道可分为两大类：离子通道和水通道。
化学传递物质和引起嗅觉、味觉的化学物质以及多种药物等，通过与细胞膜上的各相应物质进行特异结合后，才会引起其作用。这类细胞膜上的物质多为蛋白质，而称为受体蛋白质。目前对受体蛋白质已能进行分离提纯，并对其特性进行研究。例如乙酰胆碱的受体是从富于该种蛋白质的电鱼放电器官中以单纯蛋白质成分而提取获得的。对其分子量及分子结构，以及其与阻断乙酰胆碱的结合力等方面的特性，现在正在研究中。
载体蛋白质和通道蛋白质的区别细胞膜中的蛋白质载体蛋白有两类：耗能的和不耗能的,耗能的是逆浓度梯度,不耗能的是协助运输亲水性物质或大分子.通道蛋白一定是不耗能顺浓度梯度的,分为两大类：水通道蛋白和离子通道蛋白.水虽然可以扩散进入细胞,但速率太慢,水通道蛋白可以在零点几秒内运输极多分子,只用短暂开启.
1.通道蛋白参与的只是被动运输,在运输过程中并不与被运输的分子结合,也不会移动,并且是从高浓度向低浓度运输,所以运输时不消耗能量.
2.载体蛋白参与的有主动运输和协助扩散,在运输过程中与相应的分子结合,并且会移动.在主动运输过程中由低浓度侧向高浓度运动,且消耗代谢能量；在协助扩散过程中,由高浓度侧向低浓度侧运动,不消耗代谢能.（注协助扩散也属于被动运输）
