蛋白质是由核糖体合成的。如果是真核细胞，则会运输出细胞，所以又称为分泌蛋白。该种情况下，蛋白质的运输途径是核糖体到内质网，再通过出芽运输到高尔基体，再通过分泌小泡运送到细胞膜附近，通过胞吐运出细胞只有很少一部分蛋白质只需游离核糖体合成，已知大致3类： 1.核定位蛋白 2.叶绿体、线粒体蛋白 3.过氧化物酶体蛋白质
除此之外几乎所有蛋白质都需经内质网加工，大致分为三类：1.分泌蛋白，如血浆蛋白，抗体 2.膜蛋白，如细胞膜上的糖蛋白（这里可能和高中课本有区别，但实际上是书本的说法有歧义） 3.内膜系统细胞器中的可溶性的驻留蛋白，如溶酶体、液泡中的酸性水解酶 4.需要进行复杂修饰的蛋白，我才疏学浅暂时想不出例子。
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