一、概念不同
1、分子是独立存在而保持物质化学性质的最小粒子，由组成的原子按照一定的键合顺序和空间排列而结合在一起的整体，这种键合顺序和空间排列关系称为分子结构。由于分子内原子间的相互作用，分子的物理和化学性质不仅取决于组成原子的种类和数目，更取决于分子的结构。
2、原子构成化学元素的基本单元和化学变化中的最小微粒，即不能用化学变化再分的微粒，由原子核和绕核运动的电子组成。原子构成一般物质的最小单位，称为元素。已知的元素有119种。 因此具有核式结构。
二、化学变化中是否可分
1、分子在化学变化中可分。
2、原子在化学变化中不可分，原子可重新组合成新分子再构成新物质或直接构成物质。
三、特性不同
1、原子的质量非常小，且不停地作无规则运动；原子间有间隔；同种原子性质相同，不同种原子性质不相同。
2、分子之间有间隔；一切构成物质的分子都在永不停息地做无规则的运动。温度越高，分子扩散越快，固、液、气中，气体扩散最快。
由于分子的运动跟温度有关，所以这种运动叫做分子的热运动；一般分子直径的数量级为10^-10m；分子很小，但有一定的体积和质量；同种物质的分子性质相同，不同种物质的分子性质不同。
参考资料来源：百度百科－分子
参考资料来源：百度百科－原子
分子与原子的区别：在化学变化中是否可以再分。 分子是保持物质化学性质的最小粒子。原子是化学变化中的最小粒子。 （在化学变化中分子可分，原子不能再分。）
分子与原子的联系：分子由原子构成。
分子：保持物质化学性质的最小粒子。
原子：化学变化中的最小粒子。
扩展资料：
分子是保持物质化学性质的最小粒子。原子是化学变化中的最小粒子。 分子与原子 都是构成物质的一种粒子，质量和体积都非常小，彼此间有间隔，在不停地运动，都既有种类之分，又有个数之别，都不显电性。分子总是在不断的运动。
原子（atom）指化学反应不可再分的基本微粒，原子在化学反应中不可分割。但在物理状态中可以分割。原子由原子核同核内电子和核外电子构成。因此具有核式结构。原子的质量极小，一般为-27次幂，质量主要集中在质子和中子上。
原子核外分布着电子，电子跃迁产生光谱，电子决定了一个元素的化学性质，并且对原子的磁性有着很大的影响。所有质子数相同的原子组成元素，每种元素大多有一种不稳定的同位素，可以进行放射性衰变。
原子最早是哲学上具有本体论意义的抽象概念，随着人类认识的进步，原子逐渐从抽象的概念逐渐成为科学的理论。原子核以及电子属于微观粒子，构成原子。
参考资料百度百科：分子和原子
