通常在生物里面说“本底水平”这几个字，比如说某个基因的本底水平的表达量，表示的是这个基因在一般情况下的表达量，就是在没有外界环境刺激下的表达量。这样举个例子你应该好理解了吧，还有什么不清楚的可以追问的。你所说的本底（matrix）也叫基底，一般是指景观中面积最大、连通性最好的景观要素类型。
判断哪种景观类型是景观中的本底或基底，主要有3个标准：
一是相对面积，一般认为相对面积最大的景观类型就是基底，比如在内蒙古草原区，草地生态系统就可以看做是本底，它面积最大，对景观的过程以及功能都有决定性的影响。而其它的如道路、河流就是廊道，村镇、湖泊就是斑块。
二是看连通性，如果景观中的一些组分其面积虽然是不是最大，但是它在景观中的连通程度很高，对于景观的物流、能流以及物种的传输都有很重要的影响，那么这种景观类型也可以称为基底或本底。
三是看对景观动态的控制作用的大小，一般来说基底或本底对景观生态系统有主导性的结构、功能以及过程的控制作用。
上述三个标准一般情况下是不冲突的，但有时会比较难于判断。前二个标准比较容易量化、比较，第三个标准难以量化，而且需要对景观生态系统有比较深入的了解，碰到这种情况可以咨询该区域对景观生态系统比较了解的专家意见。
