当时朝廷从江南迁移大量人口到苏北一带进行垦荒，因朱元璋的部队头扎红巾，故民间称之为“红巾军”、“红军”，“洪武赶散”也被称为“红巾赶散”或“红军赶散”。“红蝇赶散”则是“红巾赶散”的讹传，可能是出于对红巾军的不满而将其暗喻为红蝇瘟疫的缘故。
苏北地区民间的传说：传说明洪武年间，苏州阊门一带生长一种毒虫，形如苍蝇，见人就螫，螫人即死。也有传说是张土诚兵败后在破庙中被人砍死，尸体腐败生出许多红蝇，红蝇见入便咬，咬到便死。于是人们畏惧那夺命的红蝇，纷纷逃离故土，携儿带女，避居他乡。当时人们把这种逃避红头苍蝇螫人的事件叫做“红蝇赶散”，又称“洪武赶散”，或叫“红君赶散”、“红蜂赶散”、“红鹰赶散”……。“蝇”、“君”、“鹰”、“蜂”土语发音近似，可知无论怎么称之，这个传说是有同源性的。
这个传说是十分恐怖的。江苏灌云县的乡民说，他们原非当地人士，祖先是“红蝇赶散”从苏州逃来的。他们讲起“红蝇赶散”无不心存余悸，说那红头苍蝇漫天飞着，见人就叮，人若被叮了十死八九，所以苏州人纷纷往北方的海边逃难。“红蝇赶散”的传说在苏北无论城乡皆有分布，除了口头流传，家谱中也有记载。东海县张湾乡紫阳堂朱氏宗谱中说，他们这一族是明朝正德四年(1509年)，被“红君赶散”，由苏州阊门外朱巷迁到新坝的。民国二十二年阜宁七修《陈氏宗谱》谱序说：“我族由兴一公避元末之乱，自姑苏至古盐之殷家庄，即今属阜邑之陈家桥遂聚族于阜焉”。陈氏族中健在老也常说起：阜宁陈氏先祖兴一公自明朝初年从苏州阊门“洪武赶散”迁阜宁，历代口口相传。
出现为害一方的夺命红蝇，仅见私修家谱中有载，为何不见地方郡守向朝廷报告？为何不见方志记载……？大凡此类奇异事件，都会记入方志“灾异门”内，为何如此规模的灾难反而会被史家所忽视呢?是否有何难言之痛？
朱元璋为何施行“赶散”？
传说有时确是历史的口碑，传说能透过迷雾折射出历史的真实，成为解决历史悬疑的钥匙。
“洪武赶散”始于明初，约四百年后的清乾隆四十四年（1779年），《新安镇源流》（冯仁宏撰）中方称道：“大明洪武登极之初，虑大族相聚为逆，使各道武员，率游骑击散，谓‘洪武赶散’，子孙相沿，传世为例。传至嘉靖，适奉旨击散，而苏之阊门周姓、常之无锡惠性，以及刘、管、段、金皆被赶散，来至朐南（原海州以南地区），芦苇荒滩，遂各插草为标，占为民地，以作避兵之计。”
《新安镇源流》所载得到一些族谱的印证。如嘉庆三年(1798年)编印的《王氏宗谱》：“明初伪王张士诚据苏，苏民四窜”；又如清初凌兰苏所著《凌氏源流考》记述：“元末张士诚据有吴门，明主百计不能下，及士诚兵败身虏，明主积怒，遂逐苏民，实淮扬两郡。”其“迁盐始祖凌公高十，原籍姑苏阊门人，因洪军驱逐，至盐城双店而止。”
比对洪武大移民及家谱所载，所谓“洪武赶散”事件便昭然而揭了。
在海属地区这种说法也极少。海属地区一般以土著居民为主。不过在洪武初年，海州地区曾大规模向外移过民，不是洪武赶散，而是因为洪武元年底的倭寇之乱，居住于沿海的居民于洪武二年大量向内陆迁移。
至今在鲁东南地区及连云港本地，提到自己的祖籍的时，往往说是来自海州或东海（连云港连云区）。反而自称来自山西却很少，自称来自苏州的更是绝少。
另外，海州在明代属于南直隶淮安府，由于东南历来朝廷赋税重地，所以在明代这一地区向南直隶其他地区一样，赋役沉重。因此好多老百姓被迫逃亡，这种现象称为“逃籍”。
由于逃籍现象严重，到了明朝中期，海州的户口已不到明初时的一半。直到本世纪七十年代，连云港市区周边还是地旷人稀之地。
