区别如下：
1、车站等级的区别：海口站为耳机站，海口东站为一等站，美兰站为客运站无等级。
2、停靠站的区别：海口站是综合型车站，停靠客车，货车，动车，海口东站停靠动车，美兰站是地下火车站，停靠客运车。
3、站台规模的区别：海口站四个硬座候车室和一个软座候车室。已铺设9条铁轨，其中，6条为货运，以满足货物进出岛的需要，海口东站是东环高铁（动车）与公交的枢纽站，美兰机场站是海南东环铁路的一个客运站。美兰机场车站属于地下车站，分为上下两层。
4、所属路线的区别：海口站是粤海线路，海口东站是海南东环线路，美兰站是，机场线路。
5、始建的区别：海口站2004年12月5日，海口站正式办理客运业务，海口东站于2009年7月30日动工，2008年5月2日，东环铁路美兰机场站正式开工。
位置如下：
1、海口站就是海口火车站，在秀英港，是所有进出岛的火车停靠的车站，也有少量动车。海口站去海口东站之间可以坐公交换乘。
2、海口东站在琼山区凤翔路，是专为城际列车要求设计的，是海口和三亚之间的动车的主要停靠站。
3、美兰站机场高铁站是一个中途站。去海口的美兰机场，高铁直到这里下车。
参考资料来源：百度百科-海口站
参考资料来源：百度百科-海口东站
参考资料来源：百度百科-美兰站
海口站是海口火车站，海口东站是高铁站。
海口东站：位于中国海南省的海口市，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的客运一等站，也是海南环岛铁路的重要的铁路车站。在2009年7月30日，海口东站开始动工建设。海口东站站房造型以“海浪”为母题，以” 椰叶”状的梭型张悬梁结构为母体，形体虚实相间，并在2010年12月30日，海口东站正式投入运营。
海口站：位于中国海南省海口市，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的客货二等站，也是粤海铁路和海南东环铁路重要的铁路车站。海口站始建于2002年2月，站房设计将交通建筑的特点与海南地域特色有机结合起来，非常具有海南地区特色。并在2014年进行了改建，2015年5月海口站正式投入运营。
