一、操作方式不同
1、门到门：由托运人负责装载的集装箱,在其货仓或厂库交承运人验收后，由承运人负责全程运输，直到收货人的货仓或工厂仓库交箱为止。
2、内装箱：在规定的时间内将货物送到货代指定的场站或仓库装箱。
二、特点不同
1、门到门：全程连线运输，送货上门，门到门含进口费用。
2、内装箱：内装箱不需要归还箱子，不是外装箱要返箱。
三、优点不同
1、门到门：这种运输方式在当今已是司空见惯，各种运输公司都能做到这点，有效地节省了收货人的时间。
2、内装箱：货物进、出仓操作流程，相关操作部门流程执行严格，特殊情况发生时各职能部门能快速负责协商解决。
参考资料来源：
百度百科-门到门
百度百科-装箱
运输风险起迄应该分为“仓到仓”和“门到门”
门到门是发货人门前到收货人门前，相对于“仓到仓”的从装运港的仓库到目的港的仓库的风险小，例如邮包运输可以做到“门到门”，海洋运输和铁路运输只能做到仓到仓
