蒙古人崇拜的图腾有狼、鹿、熊、牦牛、鹰、天鹅、树等。《蒙古秘史》开篇第一句就写着:季承四合汗的祖先是由博尔铁赤那和他的妻子霍艾玛兰乐的命运所生，即蒙古人所崇拜的图腾狼和鹿。
另外，受中原汉族文化的影响，蒙古族也崇拜龙，部分部落崇拜树木图腾、牦牛图腾等。各种图腾神话反映了蒙古民族的特点以及与北方民族特别是阿尔泰语系民族神话的许多相似之处，显示了它们之间的密切关系。
蒙古民族的狼图腾最初只是古齐燕部落博尔赫斯氏族的图腾，在《蒙古秘史》、《蒙古起源与发展》中都有记载。经过几百年的演绎，狼图腾已经被认为是整个蒙古民族的图腾。
《蒙古秘史》开篇就明确记载:“季承四合汗的祖先是由博尔铁赤那(苍白色狼)和他的妻子霍艾曼勒(白鹿)的命运所生，他们一起渡过腾吉斯海，居住在漠南河源的布尔汗山前，生下了巴塔赤汗”。反映了唐末以狼、鹿为图腾的两个蒙古部落从额尔古纳河以西迁徙的重要历史事实。
而《国虞》记载:“穆之子在西擒狗戎，夺其五王，得四白狼四白鹿归”。历史学家简伯赞考证:“白狼白鹿原是当时的宗族”。
《蒙古起源》记载，成吉思汗在狩猎时特别敕令释放“果沃马拉勒”(草黄母鹿)和“布尔泰克钦楚欧诺”(苍白色狼)这两种野生动物，可见它们是作为神兽来照顾的。
《多桑蒙古史》记载，窝阔台放飞了一只狼，希望能延长它的寿命，但当他不想要这只狼时，却“被猎狗咬死”。沃太太当时认为这是不祥之兆。果然，他很快就死了。
蒙古萨满相信鹿可以显灵驱邪。内蒙古巴尔胡、察哈尔、科尔沁等地区的萨满所戴的帽子上饰有铁制的鹿角，所用的铜镜、铜鼓也刻画了鹿的形象，说明蒙古族先民，尤其是森林猎人，是以鹿为图腾神的。
科尔沁右翼的杜尔伯特·乌尔图纳·苏贝，是成吉思汗弟弟哈萨尔的第27个孙子。他们的宗族自称鹰族，历代长子长孙都以各种鹰命名。
据《蒙古秘史》记载，成吉思汗第十世祖的小儿子布端察尔被黑。被四个哥哥抛弃后，走投无路的他不得不依靠一只老鹰来捕猎为生。他的后人，不登唯金氏，把鹰视为救世主，崇拜它为保护神。铁木真在称可汗之前被他的“安达”(兄弟之友)札木合陷害，也是猎鹰救了他。
蒙古族萨满传统认为海东青是天上神鸟的使者。它奉命下凡与部落首领结婚，生下一个漂亮的女孩，并把她培养成世界上最早的“沃杜根”(女巫师)。在布里亚特的萨满神话传说中，最早的男性萨满化身也与鹰有关。
布里亚特和达尔哈特人常称熊为祖先和圣物，并称之为“沃托格”，意为长者和老人。他们认为人是由熊演变而来的，他们称熊为祖父、父亲和祖先。这恰恰是人们把熊当成自己血亲的表现，所以用相应的亲属称谓来称呼，像亲人一样对待。
抓熊之后，似乎是古代原始习俗“图腾共融”的遗留。在原始人看来，用图腾的血肉作为圣餐，可以巩固自己与图腾的亲密关系，重新获得图腾的力量。
