扎县平均海拔4700多米，县城海拔4672米。最低海拔和最高海拔相差1900多米。申扎县属于西藏自治区那曲市。申扎藏意为纯净的盐，白色、透明、无瑕疵。据说，古纳藏德巴位于藏北高原腹地南部，冈底斯山与藏北第二大湖泊森林之间，南以念青唐古拉山为界，与日喀则市相连，北与双湖县相望，东与班戈县接壤，西与尼玛县接壤。
扎西县是那曲市的纯畜牧业县，主要饲养牦牛、绵羊和山羊。中国的格仁楚(湖)面积约700平方公里。林措(湖)面积1866平方公里，是藏北高原第二大咸水湖，也是申扎县和班戈县的界湖。
扎县属于南羌塘高原大湖盆地，地势平缓，丘陵、山地、盆地相间。丘陵和山地的相对高差一般在300-500米之间，坡度较大，地表多为风化破碎的毛石堆和残坡。地质上分为南部念青唐古拉山岩浆带和北部五大湖坳陷带。地势南高北低，海拔5900多米的念青唐古拉山向海拔4530米的色林错湖倾斜。最高峰贾岗山在中南部，海拔6448米，终年积雪。最低点是色林绰湖，距离最高峰1900多米。
