1.是利用生物技术制备的分子水平疫苗，包括基因工程亚单位疫苗、合成肽疫苗、抗特异性疫苗、基因工程活疫苗、DNA疫苗和转基因植物疫苗。
2.基因工程亚单位疫苗是通过DNA重组技术将编码病原微生物保护性抗原的基因导入受体细菌(如大肠杆菌)或细胞中，使其在受体细胞中高效表达并分泌保护性抗原肽链。提取保护性抗原肽链，加入佐剂制备基因工程亚单位疫苗。据悉，首个成功的口蹄疫基因工程疫苗，除了预防仔猪和犊牛腹泻的大肠杆菌菌毛基因工程疫苗。
