线粒体DNA位于线粒体的基质中。
DNA是脱氧核糖核酸的缩写,携带着合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息,是生物体发育和运转所必需的生物大分子。由线粒体外膜、线粒体膜间隙、线粒体内膜和线粒体基质四个功能区组成。它是细胞中产生能量的结构,也是有氧呼吸的主要场所,直径约为0.5至1.0微米。可以说,除了溶组织内阿米巴、蓝氏贾第鞭毛虫等几种微孢子虫外,绝大多数真核细胞都有线粒体。