当发电机在外部或内部发生不对称短路或当发电机供给的负荷不对称时，定子绕组就会流过负序电流。
负序电流所建立的发电机气隙旋转磁场的转动方向与转子的运动方向相反，因而该磁场就以两倍的同步速度切割转子。在转子本体、阻尼条及励磁绕组中感生出倍频电流。该电流在转子中引起额外的损耗和发热，会使发电机转子严重烧伤，且由于趋肤效应，这些电流主要集中在表面的薄层中流动，在转子端部沿圆周方向运动形成环流。这些电流流过转子的横楔与齿，并流经槽楔和齿与套箍的许多接触面。这些接触部位电阻较高，发热尤为严重。。另一方面，负序电流的旋转磁场，产生两倍频率的交变电磁转矩，也会使机组产生100Hz的振动，引起金属疲劳和机械损伤。
对于同步电机而言：不对称运行时定子负序电流所产生的负序旋转磁场对转子有两倍同步速的相对速度，将在励磁绕组、阻尼绕组以及整块转子的表面感应倍频电流，这些电流在相应的部分引起损耗和发热，是转子容易过热而烧坏。
一般而言，异步电机主要做电动机使用，所以对于异步电机，对其正常工作产生影响的负序分量主要是负序电压分量。而当负序电压存在时，电机中的旋转磁场会由原来的圆形变为椭圆形。造成的后果有以下两点：1.会引起电机振动、转速不匀和电磁噪音，引起电机的功率因数和效率变坏，严重时可造成电机停转。2.增加电机的铜耗和转子的铁耗。
