羊耳蒜：森林采伐造成本兰科植物绝灭。
沼泽兰：湿地开发造成本兰科植物绝灭。
石唇兰：园艺采集造成本兰科植物绝灭。
明党参、绶草：药材采挖造成这两种野生植物的绝灭
工蕨 、雷尼蕨 、古蕨 、褐蕨 、种子蕨 、海伦娜橄榄，百山祖冷杉 、曼佗罗、
八角莲、石桫椤、绒毛皂荚、冷杉、羊耳蒜。
八角莲，渐危种，中国特有珍稀植物。分布区较广，仅有野外零星散生。民间常用中草药，一经发现，即被采挖，亟待保护。
三峡珍稀植物园植物种类丰富，有种子植物3500余种，包括珍稀植物49种，国家保护植物近150种。三峡珍稀植物园位于重庆市万州机场下面的山沟里。
伍德苏铁，是世界上最稀有的植物之一，这一物种在野外早已绝迹，仅有的伍德苏铁也都存活在植物园。圣赫勒拿橄榄，南大西洋圣赫勒拿岛的特有种，野生的圣赫勒拿橄榄在1994年已经灭亡，而人工栽培的最后一棵也在2003年死亡。
中华古果，这是发现在中国的一种开花植物化石，距今约1亿2千多年，在我国辽西地区发现。日月潭羊耳蒜，仅生活在日月潭地区的拉鲁岛，是中国台湾的特有物种，现已完全消失，并无再发现其踪迹。
生物活化石桫椤，渐危种，又名树蕨。现仅存的木本蕨类植物，极其珍贵。蕨类植物是一种古老原始的植物，现存蕨类大多为草本。2亿年前恐龙生活年代树蕨曾遍及世界，由于地质变迁，绝大多数埋在地下成了煤炭，只有极少数幸存下。
中华蚊母，国家二级濒危珍稀植物。主要分布在海拔200米以下长江两岸陡峭山坡或悬岩石缝中，每年夏秋水涨淹没4到5个月。开红花，四季常青，形状千奇百态，根系发达，有极强固土固石作用，是极好的盆景树种。叶片为蚊虫的寄生体，故称“蚊母”。
