从长远来看，公益机构各方面都比公益机构好。
公益性事业单位主要是指以提供公益性服务或行政协助为主要职责的公共服务机构，不宜由市场配置资源。公益事业有两个明显的特点:一是全部由财政全额拨款支持；二是主要集中在科教文卫领域。如疾控中心、科技馆、图书馆、博物馆、公立中小学、乡镇卫生院等。，都是公益机构。公益事业单位是事业单位的主体。除了少数因职能相近等原因必须合并整合外，其余基本不受分类改革影响，属于事业单位中风险最低、最稳定可靠的一类。
二类公益性事业单位是指能够由市场配置资源，提供部分公益性服务的公共服务机构。第二类公益一般是差额拨款性质，由财政拨款部分支持，其余由单位自营收费资金补充。县级以上公立医院、高校、园区、房产交易所、设计院等。，基本都是公益二类。第二类公益受改革冲击较大，按经济效益划分，一般呈现三个方向:一是部分经济效益较差，主要责任为公益服务，因此剥离收费或经营责任，改为公益类；经济效益一般，能维持机组正常运行，保持现状；经济效益好，主要职责是经营或收费，剥离公益责任，转企。整体来看，二类公益机构未来可能大部分会保持现状。
公益机构和公益机构相比，从发展前景来说，公益机构更好。从收益上看，公益二类其实是高于公益类的，因为它的经营收益。比如医院就是典型；从改革的角度来看，公益类更加稳定，未来不排除取消公益二类。所以综合各方面比较，公益类无疑更有优势。
