赤藓糖醇在甜度、清凉效果、能量系数、安全性和耐受性、吸湿性、吸收和代谢等方面与木糖醇不同。此外，在生产过程中，赤藓糖醇通过发酵生产，木糖醇通过氢化生产。
赤藓糖醇是一种填充型甜味剂，是一种四碳糖醇，可以由葡萄糖发酵制成。它是一种白色结晶粉末，具有清爽的甜味，不易吸潮，在高温下稳定，在较宽的PH范围内稳定，在口中溶解时有温和的清凉感。它适用于各种食物。
赤藓糖醇是零热量的天然甜味剂，而木糖醇是有热量的。赤藓糖醇比木糖醇有更高的耐受性。木糖醇吃多了会不舒服，赤藓糖醇不容易不舒服。赤藓糖醇对血糖影响较小，具有抗氧化活性。木糖醇具有较高的相对甜度和较高的升糖指数。赤藓糖醇有较高的溶解热和吸收热，所以它的清凉效果比木糖醇好。赤藓糖醇的吸湿性比木糖醇低，赤藓糖醇在90% 空的湿度下不会吸潮，在潮湿的环境中也能保持稳定，便于储存和使用。
生产工艺上，赤藓糖醇是发酵生产，木糖醇是加氢生产。
