红薯发芽的时候可以吃，不会造成不良影响。红薯发芽后不会像土豆一样产生有害成分。只要把红薯上长的芽去掉，就可以正常食用。但需要注意的是，红薯不仅口感不好，而且发芽后会因为营养和水分的流失而失去食用价值。红薯虽然发芽的时候可以吃，但是如果表皮是褐色或者黑色的斑点就不能吃。黑斑多为黑斑菌污染所致，黑斑菌中含有红薯酮和红薯酮醇，可使红薯变硬变苦。这种毒素虽然是水煮烤过的，但是生物活性不会被破坏，吃了以后会对身体产生不好的影响。
