两者的区别在于:
1.不同含义:祖籍是指祖父及以上父系祖先的永久居住地或祖父及以上父系祖先的出生地，也称祖籍或籍贯。籍贯是指我出生时我爷爷居住的地方。
2.不同的从属关系:籍贯一般是父系，有的是母系。祖屋一般是父系祖先占主导地位。再说，一个家庭的出身可能不一样，但出身一定是一样的。
户籍地不一定是该人的祖籍或籍贯，特别是在经济发达地区和新中国成立后开始建设的一些新地方以及近代以来发展较快的地方。很大一部分人的出生地并不是户籍所在地，而这些人一般是在改革开放后或者中国计划经济时代根据当时或者近代国家的分布从其他地方迁移过来的。按照中国几千年的传统，籍贯是籍贯的一种表述，这就是户籍和籍贯的区别。
