1.最重要也是最大的区别——调节训练
医学硕士在学习期间将直接进行住院医师三年规范化培训，即定期培训和研究生教育同步进行。
医学硕士，如果毕业后想从事临床工作，一般来说还需要三年住院医师规范化培训，除非不在公立医院工作。而且你所在的医院并不要求你必须经过正规培训才能免于正规培训。这样的工作，比如艺光，医馆等等。
2.证书
专硕成功毕业后获得的文凭包括:毕业证书、培训证书、硕士学位证书、执业医师证书，也就是通常所说的四证合一。
成功毕业后，学硕可以拿到除培训证以外的三证，也就是说学硕以后从事临床，需要先培训三年，三年才能拿到培训工资。
3.初始测试
研究生初试为全国统一命题，在之前6门综合医学科目的基础上增加医学职业道德、伦理学、卫生法、临床技能等内容。具体增加的内容要等9月份大纲出来才能确定。
而学历学位的内容总体上没有变化，医学综合考试仍然是传统的六科。改变的是从17届考研开始，院校自主命题，也就是说目标院校自主命题(比如某同学是A院校的，打算考a B院校的学历学位，初试的题目都是B院校出的)，也就是说学历学位会对本校考生更有利！
4.复试
复试时更加注重专业和临床技能的考核，将设置专门的临床技能考核。
学术型硕士更倾向于专业和科研思维的考核，基本没有临床技能考核。
当然，并不是所有的高校都是这样。比如南京中医药大学，所有专业和硕士都要求临床技能考核，硕士要求普遍较低。这要看各个机构的实际安排。
5.专业规程
学硕的专业代码以100开头，转硕的专业代码以105开头。比如中医内科学专业学位的代码是:105701；中医内科学学位:100506。
6.导师
专科:由于住院医师规范化培训是在开学后马上进行临床实习，整个临床科室都是轮转的，所以和导师见面的时间很少，交流也会少很多。目前知道这个系的轮岗只有第三年，也就是说第三年跟导师的接触会比较多。
学硕:学硕从一开始就会做实验，做项目，接触老师。一般项目做完，他就可以开始在门诊跟老师学习了。
