过氧乙酸消毒剂的优点是易溶于水，使用方便，杀菌能力强，其分解产物不会对人或环境造成影响。其缺点是在未稀释状态下散发刺激性气味，性质不稳定。
过氧乙酸消毒剂的优点是易溶于水，使用方便。此外，这种消毒剂杀菌能力强，使用时能迅速发挥其消毒效果。同时，当其用于物品表面时，不会对物品造成染色、褪色或其他损伤。
过氧乙酸消毒液的分解产物有醋酸、氧气或水等。这些物质都是无毒的，所以使用过氧乙酸消毒液后，基本不会有有毒成分残留，不会对环境造成污染，也不会对人的健康造成影响。
过氧乙酸消毒剂的缺点是不用水稀释时会散发出难闻的刺鼻气味，对人有刺激性和毒性。而且过氧乙酸容易分解，性质不稳定，配置时浓度很难掌握。
