南通有9个高铁（火车站）站，分别是：海安站、如皋南站、南通西站、南通火车站、如皋站、海门站、启东站、栟茶站、如东火车站具体位置如下：
1、海安站
海安站位于南通市海安市迎宾路98号，站内有进站口、出站口、出站等出入口，另外还有社会车辆停车场、地下停车场、售票处等设施。
2、如皋南站
如皋南站位于江苏省如皋市城南街道龙游湖东侧。如皋南站是中国铁路上海局集团有限公司管辖的铁路车站，也是盐通高速铁路的中间站。
3、南通西站
南通西站位于江苏省南通市通州区尧盛路，站内有出站口等出入口。南通西站是中国铁路上海局集团有限公司管内铁路车站，是沪苏通铁路、盐通高速铁路、通苏嘉甬高速铁路的交汇车站。
4、南通站
南通站位于江苏省南通市崇川区永兴大道与北大街交汇处北侧，站内有进站口、出站口、南口等出入口，另外还有停车场、P4停车场、售票厅、P3停车场、停车场东环路等设施。
5、如皋站
如皋站位于南通市如皋市如城镇福寿东路，站内有进站口、出站口等出入口，另外还有停车场等设施。
6、海门站
海门站位于江苏省南通市海门市新占路，站内有出站口等出入口，另外还有停车场、售票处等设施。
7、启东站
启东站位于江苏省南通市启东市中群北路，站内有进站口、出站口等出入口，另外还有充电站等设施。
8、栟茶站
栟茶站位于江苏省南通市如东县栟茶镇站前路南50米，另外还有停车场等设施。
9、如东站
如东站位于江苏省南通市如东县苴镇刘埠村，站内有西南进站口、西南出站口等出入口，另外还有停车场、售票处等设施。
启东有高铁站，即海门高铁站。
海门站是中国铁路上海局集团有限公司管辖的铁路车站，位于中国江苏省南通市海门区，是宁启铁路线上站点之一，为客货运站，长三角铁路第三批启用电子客票的车站（2019年11月26日）。
海门站离市中心约4公里，宁启高速公路南侧，设计面积8000平方米，工程投资估算8100万元。按照规划，旅客发送量为每年250万人次，设计年货物运量近期为45万吨，远期为90万吨。宁启铁路全线设南通东站、海门站、临江站、启东站、吕四站等5个车站。
海门站设计理念：
海门站工程宁启铁路海门火车站立面的设计理念体现现代化风格，并充分融入了海门的城市特征。整个立面呈波浪形，弧形的屋顶线条优美劲挺，统领下部的波浪造形，体现出海门城市驾驭江海、破浪前行的发展势头。
海门站房正立面的拱造形自由舒展，喻意海门交流开放的城市理念和热情好客的城市性格。正立面上波浪形的立体结构高低变换，连续不断，蜿蜒伸展，象征着江与海的融汇交响，呼应城市的地域自然特征。海门是闻名的“纺织之乡”，建筑立面层叠的百叶提取地域文化元素。
