外三元和内三元的区别在于性质、特点、价格不同。
外三元:母本、第一父本、第二父本均为国外纯种猪，杂交产生三元杂交瘦肉型猪。一般长白猪先与大白母猪配种，二元杂交中的母猪长大后与杜洛克公猪配种，再进行三元杂交，其后代称为三元杂交。它是由国外品种杂交而成，杜洛克公猪为父本，长白猪和大白母猪杂交选出的杂交母猪为母本进行配种。杜洛克第二代杂种猪是三元猪。这些种猪都是国外的。
内三元:以本地优良母猪与约克夏公猪为母本杂交，再以杜洛克或长白猪为第二父本与二元母猪杂交，生产出第一代杂交母猪，即二元母猪。如果这三个品种中有一个或两个中国品种，称为内三元品种，如长白猪、大白猪、东北朱敏猪；如果这三个品种都是中国的地方品种，则称为土三元或土杂猪、内江猪、荣昌猪、滇南小耳猪。中国地方良种猪一般繁殖性能好，产仔数大，母性好。
相似之处:以繁殖性能好的品种为母本，速生品种为父本，然后进行最佳杂交组合筛选试验，选出最佳杂交组合。
