苏州轨道交通3号线自东向西，起于苏州新区火车站，途经苏州高新区、姑苏区、吴中区、苏州工业园区，止于唯亭站。起点:苏州新区火车站位于苏州高新区北部。通过沪宁城际铁路后，转向余音路设置会昌路站。
出站后穿越京杭大运河，在文昌路路口设置文昌路站，然后转珠江路向南，在新亭路路口南侧设置长汀站，在庐山路路口设置铜墩站；之后，线路转向马云路，设置马云路站。出站后转长江路。西津桥站和河山站分别设置在华山路和河山路交叉口。
与苏州轨道交通1号线狮子山站换乘后，进入狮山路，在塔园路路口设置狮山路站，然后向南转滨河路，依次为沙金桥站、索山桥西站、横山站、横塘站，沿柯华路在胥江下设置石湖北站。
线路经过京杭大运河后，沿太原街设国鑫站。出站后转向宝带西路，沿宝带西路、宝带东路向东铺设，依次设置李攀路站、宝带路站、迎春路站；线路穿越京杭大运河后，将沿北港路设置北港路站。
线路经过苏嘉杭高速后，沿群星二路设置童渊路南站，然后线路转向兴港街向北，依次经过朴树路北站、东镇路站、金社桥站、巩俐大坝西站、东方门站、烟雨桥站。过娄江后，在娄江高速与沪宁城际铁路之间设置泥浜站。
出站后向东转入保亭大道，设置唐庄站、跨塘站，然后转向沪宁城际铁路苏州公园站，沿河西路北侧设置苏州公园站，出站后转向保亭大道，然后在路口依次设置万芳街站、丰和路站、马爽街站、保亭大道站、葛巷街站，最后到达终点站唯亭站。目前来说，苏州有4个高铁站，分别是：苏州站(苏州市姑苏区苏站路27号)，苏州园区站(苏州市苏州工业园区至河西路)，苏州北站( 苏州市相城区南天成路)，苏州新区站(苏州市虎丘区城际路)。
苏州的高铁站有几个
苏州站、苏州新区站和苏州园区站在沪宁城际线上，苏州北站在京沪高铁上。同时，苏州站也在京沪铁路上。
在这4个车站当中，每一个车站都有高铁(G字头列车)停靠，但是普速列车(普客、K、T、Z)仅有苏州站停靠。所以，4个车站都可以称为高铁站。
苏州站站房建筑面积为54000平方米，采用线上高架候车结构，包括南北两个站房和高架站房，并在北站房设置站前高架和落客平台。
