邵阳至广州南G9939次列车确实停运了。根据中国铁路广州局集团有限公司关于2020年2月1日至3月1日期间部分旅客列车临时停运等事项的公告：2020年2月2日至2月11日，邵阳开G9942/39次旅客列车临时停运。
广州南到邵阳站（邵阳南站）一天有一趟直达高铁，车次信息如下：
邵阳火车站：简称邵阳站(铁总文件的正式名称也叫邵阳站)，当地居民也习惯称为邵阳南站。位于湖南省邵阳市大祥区，上行离娄底站108公里，下行离永州站111公里，属于广铁集团管辖，邵阳火车站综合楼面积为11300㎡，候车室面积为2891㎡，扩建后的规模为5台13线，洛湛铁路（的老娄邵铁路段和邵永铁路段）、娄邵快速铁路和在建的怀邵衡快铁均在此交汇。
