在南京秦淮区办理台湾通行证可以先进行网上预约，然后携带身份证或其他特殊身份材料在预约的时间到秦淮区出入境受理点进行办理。
台湾通行证（大陆居民往来台湾地区通行证）是中华人民共和国公安部发给大陆居民前往台湾地区的旅行通行证件。
根据南京市人民政府规定，可以办理地点如下：
南京市玄武区红山路196号
南京市秦淮区马道街9号
南京市建邺区雨润大街99号
南京市鼓楼区山西路84号
南京市浦口区江浦街道龙华路5号
南京市化学工业园区杨新路188号
南京市栖霞区尧化门街141号
南京市雨花台区软件大道106号1幢（雨花台区行政服务中心一楼）
江宁区杨家圩2号江宁区市民中心（C区）
资料来源：公安出入境网上办事平台网页链接
南京共有21个地方周六可以办理台湾通行证个人旅游签注，分别为：
1.南京市公安局出入境接待大厅
白下路173号
025-84420004
周一至周五：8:30-17:00周六：9:00-17:00，
全业务受理
2. 鼓楼区公安分局出入境接待大厅
定淮门大街1号
025-83230003
周一至周五：8:30-17:30周六：9:00-12:00，13:00-17:00（夏季14:00-17:00）
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
3.建邺区公安分局出入境接待大厅
雨润大街99号
025-58950841
周一至周六：9:00-12:00,13:30-17:30（夏季14:30-17:30）
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
4.玄武区公安分局出入境接待大厅
红山路196号
025-84427165
周一至周五：8:30-17:30周六：9:00-12:00,14:00-17:00
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
5.秦淮区公安分局出入境接待大厅
马道街9号
025-84426354
周一至周五：9:00-17:00周六：9:00-12:00,14:00-17:00
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
6.雨花台区公安分局出入境接待大厅
软件大道106号1幢
025-84426711
周一至周六：9:00-12:00,13:30-17:30（夏季14:30-17:30）
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
7.栖霞区公安分局仙林大学城栖霞区行政服务中心受理点
文苑路118号仙林商务中心
025-83148762
周一至周五：9:00-17:30，周六：上午：9:00-12:00；14:00-17:30
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
8.江宁区公安分局出入境接待大厅
杨家圩路2号
025-69977093
周一至周六：8:00-19:00仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
9.浦口区公安分局出入境接待大厅
江浦街道象山路4号B座
025-58195291
周一至周五：9:00—12:0014:00—18:00（夏季14:30-18:00）周六：9:00-12:0014:00-17:00（夏季14:30-17:00）
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
10.江北新区公安分局出入境接待大厅
地铁3号线泰冯路地铁站（1、8号口入）
025-83146072 周一至周五：9:00-17:30周六：9:00-11:30,14:00-17:30
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
11.溧水区公安分局溧水区政务中心出入境受理点
永阳街道天生桥大道600号B三区
025-56222636
周一至周五：8:30-11:3014:00-17:30周六：8:30-11:3014:00-17:00
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
12.高淳区公安分局高淳区政务中心出入境受理点
淳溪镇康乐路195号
025-57347894周一至周五：8:30-11:4513:30-17:00周六：8:30-11:3013:30-16:30
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
13. 六合区公安分局六合区政务中心出入境受理点
龙池路333号
025-57131306
周一至周五：8:30—12:0014:00—17:30周六：9:00-11:3014:00-17:00
仅受理护照、港澳台证件首次申请及过期证件换发，港澳台仅办理旅游类签注
有8个地方有自助签注机，可以24小时服务：
14. 南京市公安局出入境接待大厅24小时自助服务点
白下路173号
025-84420018
全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务及取证业务
15. 鼓楼区宁海路警务站港澳台自助签注点
虎踞北路和北京西路路口
025-88043316全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
16. 栖霞区迈皋桥警务站港澳台自助签注点
华电北路和寅春路路口
025-83148716全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
17. 江北新区十村警务站港澳台自助签注点
新华路497号
025-83146653
全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
18. 玄武区梅园警务站港澳台自助签注点
珠江路未来城488号
025-84426589全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
19. 建邺区江东警务站港澳台自助签注点
江东中路98号万达广场东北角
025-84424676
全年无休（24小时服务）仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
20. 建邺区奥体警务站港澳台自助签注点
梦都大街和江东中路路口
025-84424672
全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
21. 秦 淮区瑞金路警务站港澳台自助签注点
龙蟠中路260号
金润发超市口
025-84426383
全年无休（24小时服务）
仅受理港澳台通行证旅游类签注再次申请业务
