南京一共是有5个火车站，分别是：南京火车站，南京南站，仙林站，中华门站，溧水站。
南京火车站地址：南京市玄武区龙蟠路111号。
南京南站地址：南京市雨花台区玉兰路98号。
仙林站地址：南京市栖霞区仙林大学城仙新路。
中华门站地址：江苏省南京市秦淮区应天大街335号附近。
溧水站地址：南京市溧水区站前大道。
南京站简介
南京站位于中国江苏省南京市玄武区，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客运一等站，是南京铁路枢纽的重要组成部分。南京站前临玄武湖，后枕小红山，是中国唯一临湖依山的火车站，被誉为“中国最美火车站”。
南京站始建于清朝光绪三十一年（1905年），原址位于南京下关地区；1968年9月迁入现址，与南京长江大桥同时建成投入使用；2005年7月完成改建工程，并首次采用“高进低出”的方式，成为中国各地火车站新建改建的范本；2014年8月启用新建的北站房和北广场。
以上内容参考 百度百科—南京站
南京站是指位于中央门附近的火车站。南京站，是南京市区内的综合性火车站，开行从绿皮车到高铁的所有车型，是南京主要的客运火车站，也是华东重要的交通枢纽。
顺便解释下其他几个火车站。
南京南站，位于京沪高铁线路上的主要中间站点，仅开行G车，D车，开行列车主要为京沪方向，上海武汉方向。值得一提的是，南京南站将是今年开通的宁杭城际高铁的起点站。
南京西站，位于下关江边的火车站，曾经是南京的火车终点站，也是华东重要的铁路枢纽，现已停止客运，仅货运。
南京北站，位于浦口江边，是民国时的京浦线终点站，早已停运多年。现仍保留基本历史原貌。
南京东站，位于栖霞区的一个小站，专门为那边的化工厂货运所用，现在无客运，可以忽略其存在。
中华门站，是位于市区南部的一个老火车站，在有高铁以前曾经叫“南站”，自从有高铁后正式称为“中华门站”。现在仍承担少量客运，例如南京往黄山的普通列车会停中华门站。
仙林站，位于城东仙林区域以北，是南京站与上海站之间的沪宁城际高铁线上的一个小站，仅开行D，G车。由于离南京站很近，虽然南京到上海的DG车很多，停仙林的却很少。
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顺便提一下，叫南京X站的，一般都是指火车站，汽车站会说南京客运X站，或者南京长途X站。
有好多，主要的有下面几个：1、江北的浦口站，就在浦口码头旁边。原来叫南京北站，是一座百年老站，现在已经不怎么用了，但还是担负着备用站的作用。
2、江北的六合火车站，就是现在的南京北站，是一座新火车站，具体地址我也不知道.
3、南京站，就是中央门那个。
4、南京西站，在下关。靠近中山码头。
5、南京南站，就是中华门站，在中华门外的集合村路上。
6、南京光华门站，在白下区石门坎，就在秦淮河边上。
7、龙潭站，好像也叫南京东站，在栖霞区龙潭镇，是一个编组及让车的车站。
8、林场站，在浦口林场。
其他的小站还有好多。
