南京各个线路地铁运营时间不同，具体的12条路线的运营时间如下。
线路运营时间和线路信息。
1，南京地铁1号线。
首末班车时间。迈皋桥05:42 - 23:19 | 中国药科大学05:47 - 23:27。
线路信息。新街口站换乘2号线，安德门站换乘10号线。
2，南京地铁2号线。
首末班车时间。油坊桥06:00 - 23:00 | 经天路06:00 - 23:00。
线路信息。新街口站可与1号线换乘，元通站可与10号线换乘。
3，南京地铁3号线。
首末班车时间： 林场06:00 - 23:00 | 秣周东路6:00 - 23:00。
线路信息：开工时间：2010年12月1日； 开通时间：2015年4月1日。
4，南京地铁4号线。
首末班车时间： 仙林湖06:00 - 23:00 | 龙江06:00 - 23:00。
线路信息：南京地铁4号线一期途径鼓楼区、玄武区、江宁区和栖霞区，线路西起龙江站，由南京主城一路向东。
5，南京地铁10号线。
首末班车时间： 安德门06:00 - 23:40 | 雨山路6:00 - 23:00。
线路信息：2014年7月1日已经开通。
6，南京地铁机场线(S1)。
首末班车时间： 南京南站6:00 - 22:00 | 禄口机场6:40 - 22:00。
线路信息：开工时间：2011年底； 开通时间：2014年。
7，南京地铁宁天城际(S8)。
首末班车时间： 泰山新村06:00 - 21:00 | 金牛湖06:00 - 21:00。
线路信息：本线路与其他线路暂无换乘。
8，南京地铁S1号线(机场线)。
首末班车时间： 南京南站06:00 - 22:40 | 空港新城江宁05:57 - 22:40。
线路信息：开工时间：2011年底； 开通时间：2014年。
9，南京地铁S3号线(宁和城际)。
首末班车时间： 高家冲06:00 - 22:00 | 南京南站06:00 - 23:00。
线路信息：南京地铁宁和S3号线开通，全长36.22公里，共有19座车站，其中将设置7个换乘站。
10，南京地铁S7号线(宁溧城际)。
首末班车时间： 空港新城江宁06:00 - 22:00 | 无想山06:00 - 22:00。
11，南京地铁S8号线(宁天城际)。
首末班车时间： 泰山新村06:00 - 22:00 | 金牛湖06:00 - 22:00。
线路信息：本线路与其他线路暂无换乘。
12，南京地铁S9号线(宁高城际)。
首末班车时间： 翔宇路南06:00 - 22:00 | 高淳06:00 - 22:00。
线路信息：南京地铁S9号线（又称宁高线）是南京地铁第九条建成运营的线路，也是南京地铁线网中一条南北走向的线路。
南京地铁S1号线地铁运营时间首末班车：南京南站：06:00-22:40，空港新城江宁站：05:57-22:40。
车站名称－往南京南站首班车－往南京南站末班车－往空港新城江宁站首班车－往空港新城江宁站末班车。
南京南站－6:34－23:17－6:00－22:40。
翠屏山站－6:30－23:13－6:05－22:45。
河海大学·佛城西路站－6:26－23:09－6:09－22:49。
吉印大道站－6:22－23:05－6:12－22:52。
正方中路站－6:18－23:00－6:17－22:57。
翔宇路北站－6:11－22:54－6:24－23:04。
翔宇路南站－6:07－22:49－6:29－23:09。
禄口机场站－6:00－22:42－6:36－23:16。
空港新城江宁站－5:57－22:40－6:38－23:18。
南京地铁S1号线基本信息：
南京地铁S1号线（又称机场线）是南京地铁第一条连通机场的地铁线路，于2014年7月1日正式运营，标志色为青绿色。
南京地铁S1号线途经雨花台区和江宁区，线路北起南部新城的南京南站，一路南下经过江宁大学城西侧、江宁经济技术开发区、秣陵片区、禄口新城、禄口机场，南至空港新城江宁站。
南京地铁S1号线全长37.3千米，其中地下段19.7千米、过渡段0.7千米、高架段16.9千米；共设置9座车站，其中地下站6座、高架站3座；列车采用B型鼓形列车6节编组，最高运行时速100千米/时，由中国中车南京浦镇车辆有限公司制造。
截至2020年12月，南京地铁S1号线日均客流9万人次。2019年5月1日的14.5万人次为地铁S1号线最高单日线路客运量。
地铁S1号线首末班车时刻表如下：禄口机场站首班车时间为：6：36（往空港江宁站方向），6：00（往南京南站方向）。
迈皋桥站、红山动物园站、南京站、新模范马路站、玄武门站、鼓楼站、珠江路站、新街口站、张府园站、三山街站、中华门站、安德门站、天隆寺站、软件大道站、花神庙站。
南京南站、双龙大道站、河定桥站、胜太路站、百家湖站、小龙湾站、竹山路站、天印大道站、龙眠大道站、南医大·江苏经贸学院站、南京交院站、中国药科大学站。
注意事项：
单趟运营时间约为35分钟。地铁S1号线一期工程即机场线，为南北向线路，北起南京南站，经江宁经济技术开发区、秣陵工业区、禄口新城，南至南京禄口国际机场。运营速度：最高100kmh，线路总长35.8千米。
南京南站到禄口机场，地铁最早班6点发车，从南京南站乘坐地铁s1号线，经过7站，到达禄口机场站。步行约940米，到达南京禄口国际机场。
