义和团并没有同一的首领。赵三多比较有名。
阎书勤（1860—1900)，冠县梨园屯(今属河北省威县)人，领导了冠县起义（最早的）。
赵三多(1841—1902)，领导过冠县起义，打出“扶清灭洋”的旗帜，义和团失败后参加景延宾起义而在此过程中殒命。
朱红灯（？—1899），领导过平原起义，击败县令蒋楷，在森罗殿战斗中战败，后被捕处死。
林黑儿（(?—1900？)，自称“黄莲圣母”，是红灯照的领导者，天津失陷后被俘，不知所终。
王立言（？—1899，山东义和团主要首领之一，朱红灯死后在山东坚持战斗，后失败被杀。
倪赞清（1862—1902），字翼臣，组织和指挥了著名的廊坊大捷。
曹福田（？—1901），天津义和团首领。在老龙头火车站与八国联军激战。
张德成（1846—1900）在独流镇创建“天下第一团”，后率部赴天津与联军战斗。
刘呈祥（1881—1900）别号刘十九，1900年19岁时在天津西郊高家庄设乾字坛，后在天津打击八国联军，天津失陷后仍坚持战斗。
义和团很松散，没有统一的领导者。洪秀全是太平天国的领导者在义和团爆发前几十年已经死去。义和团的起源有多种说法
1.白莲教说，这一看法的代表是劳乃宣的《义和拳教门源流考》。认为义和团起源于白莲教。
2.大刀会说，大刀会是清代华北由贫苦农民为主的一个团体，成员演练“金钟罩”，认为可以刀枪不入，也被认为是义和团的起源之一。
3.乡团说，也有部分人认为义和团起源于民间的乡团组织。
4.拳会说，在清代有许多传播武术的民间团体，如义和拳、梅花拳等，特别是义和拳在长期发展中蒙上了浓厚的民间宗教色彩。被认为是义和团的前身。 义和团的成分极为复杂，既有贫苦农民、手工业者、城市贫民、小商贩和运输工人等下层人民，也有部分官军、富绅甚至王公贵族，后期也混杂进了不少流氓无赖，“上自王公卿相，下至娼优隶卒，几乎无人不团”使得义和团的组织极为松散，不利于集中力量打击敌人。
