克隆技术的应用大致有以下好处：
一、利用克隆等生物技术,改变农作物的基因型，产生大量抗病、抗虫、抗盐碱等的新品种，从而大大提高农作物的产量。
二、培育大量品种优良的家畜，如培养一些肉质好的牛、羊和猪等，也可以培养一些产奶量高，且富含人体所需营养元素的奶牛。
三、对医疗保健工作产生重大影响，如依靠分子克隆技术，搞清致病基因，提出疾病产生的分子生物学机制；将一头奶中含有治疗血友病的药物蛋白的转基因羊进行克隆，则可以较好地满足血友病人食疗的需要；为器官移植寻求更广泛的来源，将人的器官组织和免疫系统的基因导入动物体内，长出所需要的人体器官，可降低免疫排斥反应，提高移植成功率。
四、为保护环境和濒危动植物，以克隆技术再现物种。
五、为医学研究提供更合适的动物，大大提高试验的精确度和安全性。
六、可以在短时间内培育出大量农作物，可以缓解粮食危机。
克隆技术的利与弊如下：
利：克隆技术给人类带来的好处，是可以大量培育品种优良的家畜，丰富人民的物质生活，使畜牧业的成本降低，效率提高，还可以提供提高人类免疫功能。利用克隆技术可以大量复制珍稀动物、挽救濒危物种，调节大自然的生态平衡为人类造福。
弊：克隆将减少遗传变异，通过克隆产生的个体具有同样的遗传基因，同样的疾病敏感性，一种疾病就可以毁灭整个由克隆产生的群体。 可以设想，如果一个国家的牛群都是同一个克隆产物，一种并不严重的病毒就可能毁灭全国的畜牧业。
克隆的早期研究
同一克隆的所有成员的遗传构成是完全相同的，例外仅见于有突变发生时。自然界早已存在天然植物、动物和微生物的克隆，例如：同卵双胞胎实际上就是一种克隆。
然而，天然的哺乳动物克隆的发生率极低，成员数目太少（一般为两个），且缺乏目的性，所以很少能够被用来为人类造福，因此，人们开始探索用人工的方法来生产高等动物克隆。这样，克隆一词就开始被用作动词，指人工培育克隆动物这一动作。
目前，生产哺乳动物克隆的方法主要有胚胎分割和细胞核移植两种。克隆羊“多利”，以及其后各国科学家培育的各种克隆动物，采用的都是细胞核移植技术。
