1、六偏磷酸钠本身无毒，使用方法正确时对人体无害。但是如果未正规使用，如混杂其他物质、添加过量等，长期大量使用可能会对人体有害，可能出现中毒、氟骨症等。此外，六偏磷酸钠包括食品级和工业级，其中食品级可以食用而工业级不能食用，但可正常与人体接触。
2、中毒：食品级六偏磷酸钠中有少量重金属如铅等物质，长期大量食用后会出现全身慢性中毒反应，如皮肤色素角化、癌变等。而工业级六偏磷酸钠由于未清除对机体有害的化学成分，属于化学物质，禁止食用，误服可能导致中毒，严重者会有生命危险；
3、氟骨症：食品级的六偏磷酸钠有氟化物，若在使用时添加过量，长期大量食用添加此物质的食物可能会导致氟骨症，使骨骼中钙质减少，造成骨质疏松等。
4、此外，无论是添加了食品级六偏磷酸钠的食物，还是添加了工业级六偏磷酸钠的产品，均需注意选择具备相关资质的厂家，避免购买假冒产品。
六偏磷酸钠呈弱酸性，食品级的六偏磷酸钠是合法的食品添加剂，常作为酸度调节剂。洗衣粉中的六偏磷酸钠为工业级的六偏磷酸钠。只要正确地使用六偏磷酸钠是没有毒的。洗衣粉只能接触不能食用，饮料里添加的量必须小于1g/kg。就像食用盐可以适当食用，但是工业盐却不能食用否者容易中毒一个道理:主要是因为化学物质本身无毒但是因为其其他的化学属性过量食用会造成身体机能紊乱，甚至因为含有其他有害杂质而中毒。
