珊瑚通常有大量的共生藻类生物，如黄藻。黄藻是单细胞藻类中最重要的一种。两者各取所需，互相提供食物。全球变暖导致的海水变暖导致虫黄藻等藻类大量繁殖，进而导致珊瑚本身死亡，导致白化。然而，人们发现，珊瑚可以通过选择其他具有耐热性的藻类来应对气候变暖带来的挑战。
黄藻可以为珊瑚礁提供高达90%的能量需求。作为回报，珊瑚提供保护、庇护、营养(主要是含氮和磷的废物)和持续供应二氧化碳进行光合作用。
通过排出营养物质、光线和多余的细胞，珊瑚可以控制虫黄藻的数量，以防止其过度繁殖。黄藻也生活在其他原生动物(如有孔虫和放射虫)和一些无脊椎动物中。
