在NTU有四个校区，占地约9000亩，其中三个在南京，一个在苏州。分布如下:
1.仙林校区是主校区，占地4910亩，主要作为NTU文科和理科基地。
2.鼓楼校区占地900亩，主要是科技产业园基地。
3.浦口校区占地1200亩，主要是医学生命科学基地。
4.苏州校区占地2000亩，主要是工程基地。
