其实使徒行传第二部是第一部的前传。第二部讲的是一个警察被杀后,拯救卧底,寻找幕后警察的心路历程。两部剧其实是倒叙关系。讲述了卓凯与潜伏在泰国的手下一起剿灭毒枭的行动。
2010年10月,卓凯去了泰国,和他的卧底警察见了面。当行动结束,所有人都要离开泰国时,一场爆炸让所有卧底永远留在了泰国。卓凯因为接了一个电话就和卧底逃脱了,这是他人生中最大的污点和心理阴影。
不仅他怀疑自己,就连他的老板也怀疑他。他回到香港后,警方对他进行了调查,并撤销了他的职务。卓凯的好朋友也因为不明原因被杀。他的好朋友李瑞全被杀后,手下只剩下一名女警郑了,而郑还没有成为一名合格的卧底,李瑞全手中的卧底资料已经全部删除。要查清李瑞全受害的真相,就要把这些卧底特工全部查清楚,这也是卓sir等人面临的最大问题。
他和郑开始了全面的寻找卧底,并在寻找卧底的过程中与坐在长兴阁的魏德新不期而遇,进而带出警局最大的黑警和黑恶势力联手牟取暴利的幕后真相。