由于创业板进入门槛低，退市可能性大，创业板市场的风险大于主板市场。而且创业板的设立主要以高科技公司为主，大多经营业绩不稳定，规模较小，这也是创业板风险存在的客观事实。以下是五种主要风险:
1.创业板公司的产品基本都具有高科技产品的特征，但是这些产品和技术的更新速度比较快，对技术人员的依赖比较大。一旦受到产品和技术落后、人才流失、技术改进失败或淘汰等因素的影响，对上市公司业绩的影响是巨大的。
2.一般来说，创业板上市公司规模小，经营时间短，受市场风险和行业风险影响较大，从而影响股价的波动幅度。
3.对于创业板公司的很多新行业、新商业模式，传统的估值分析方法并不适用，新行业、新模式的估值也不是很准确，存在一定的估值风险。
4.因为创业板股票发行量小，庄家操纵成本低，容易被过度炒作。股票的波动比较大，风险比较大。
5.创业板很多是民营企业，甚至一些家族企业，在经营管理上存在一些问题。
6.创业板有“直接退市”规则，不会像主板一样出现ST、*ST等警示性过渡阶段。公司主板连续亏损，还能通过买壳借壳实现最后的重组，这在创业板是完全不可能的。
