南京大学和南京理工大学是全国排名前两位的大学。2019年最新一轮全国大学排名中，南京大学排名第8，南京理工大学排名第50。总的来说，这两个学校有以下不同之处:
1.不同类型学校南京大学属于综合类，南京理工大学属于理工科类。南京大学的院系设置比较全面，有33个系；南京理工大学偏爱理工科专业，共有20个院系。南京大学有86个本科专业，南京理工大学有38个本科专业。
2.主管部门不一样。南京大学的主管部门是中华人民共和国教育部，直属中央，副部级；南京理工大学的主管部门是中华人民共和国工业和信息化部。
3.学校属性不同南京大学是全国重点大学、985工程、211工程、双一流(世界一流大学a类建设大学)院校；南京理工大学是全国重点大学、211工程、985平台、世界一流学科建设大学。相比之下，南京大学更拔尖。
4.不同办学层次南京大学的办学层次为:世界知名高水平大学(顶尖)；南京理工大学是中国一流大学。
5.不同重点学科南京大学拥有15个世界一流学科建设学科、8个国家重点学科和13个二级学科；南京理工大学拥有1个世界一流学科建设学科，2个一级国家重点学科，7个二级学科。
6.不同校史南京大学最早可以追溯到孙吴永安元年(258)的南京太学。现代学校历史始于1902年创办的三江师范学校。1949年，中国最高学府国立中央大学更名为国立南京大学。1950年称南京大学，沿用至今。南京理工大学创建于1953年。其前身是中国人民解放军军事工程学院(简称“哈尔滨军工”)炮兵工程系。
7.学校简称，学校代码，地理位置都不一样。南京大学简称南大，学校代码为10284。校址位于南京市鼓楼区汉口路22号。南京理工大学简称南理工，学校代码为10288。其地址位于南京市玄武区孝陵卫街200号。
无论如何，边肖认为这两所学校是中国的好大学。虽然南京大学各方面都比南京理工大学强很多，但南京理工大学也培养了很多类似任新民、李洪志、崔、等国的研究所和科技人才。
