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人的掌纹始于胚胎发育，胎儿在子宫内生长三个月时，就已经开始形成掌纹。具体来说，人体的肌理在胚胎第13周开始发育，大约在第19周完全成型。在此期间，皮肤的真皮乳头会向表皮突出，从而形成无数排列整齐的乳头线(也叫脊线)，乳头线之间形成许多凹沟，皮肤的纹理也正是由这些脊和沟组成的。手的纹理也是这样产生的，就是指纹和掌纹。
胚胎质地的形成也与胎儿在母体中的姿势有关。大多数胎儿在子宫内会握紧双手，这种姿势在出生后可以持续一段时间。手的握姿和压力使掌纹的三条主线变得又深又长。如果胎儿的五指分开成掌，三条主线会变浅或断续。人类三条主线的长度、弧度、纹理的分支形状，在血缘相近的人手中是相似甚至相同的。
而且出生后掌纹会不断变化，会随着疾病、饮食、情绪、环境的影响而变化。比如失眠者的掌纹会太长，这多是长期神经衰弱导致的失眠。
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