现实生活中，有两个绝佳的样本来分析这个问题:
一个是哈布斯堡家族，欧洲皇室，是家族内部近亲结婚。200多年来，人口越来越少，后代无论是身体还是精神都出现了巨大的问题，最终断绝了子女，导致家族灭亡。
另一个是沙特王室，通过连续的婚姻和家族成员的近亲，沙特王室在最近90年的时间里将人数扩大到了5000多人。
这两个家族之所以选择近亲结婚，原因只有一个，就是为了防止皇权下降，通过不断的内部联姻，将最高权力掌握在家族手中。
日本皇室也是近亲结婚的重灾区。
哈布斯堡家族哈布斯堡家族最显著的特点之一就是长着长长的鞋拔子脸，被网友称为“鞋拔子脸家族”。家族成员认同度很高，眼睛鼓鼓的，遮天蔽日，上下嘴的牙齿合不到一起。
早期哈布斯堡家族成员众多，是一个庞大的家族。但随着不断的近亲繁殖，生下来的孩子畸形夭折，以近亲繁殖为代价，人数迅速减少。
这个家族到了最后一代卡洛斯二世，经过200年的血缘婚姻，家族只剩下一名男性成员，但不幸的是，他失去了生育下一代的能力，家族最终随着他的离去而消亡。
卡洛斯二世
沙特王室联姻近亲。沙特王室的选择和哈布斯堡家族一样。它害怕失去权力，基本不与外界通婚。老国王伊本·沙特于1932年建立了这个国家。时至今日，近90年过去了，家族成员扩大到5000多人。以沙特王室目前奢侈的生活方式，人口不受限制。可想而知，命运估计和明朝差不多。
1953年老国王去世后，沙特开始实行独特的兄弟会制度。哥哥去世后，排在第一位的弟弟接手。老沙特老当益壮，光儿子就有43个。因为独特的继承制度，儿子很多，所以老国王的儿子要么特别能忍，要么运气特别好。否则，他们不是每个人都有机会坐上王位。
沙特王室成员
这些老国王的许多儿子在继承王位之前就去世了。那么他的后代在整个皇室中就比较弱了。我们做什么呢
找靠山的唯一办法就是找靠山。自古以来，婚姻就是一种好的方式，结婚的对象是现存的国王或其直系后裔，以及最有可能坐上王位的下一代。
此时，出现了非常混乱的一幕。表亲近亲结婚，这是常规操作。表亲近亲结婚，也很常见，甚至叔伯娶侄女。我真不知道该怎么称呼它。
即使是这么近的亲戚，从媒体上看到的沙特王室成员不仅漂亮，而且聪明(经常往美国大街上扔钱，收钱的时候还在美国人脚下爬行)。
由此可以看出，沙特的剧本走向似乎与哈布斯堡家族有些不同，其近亲结婚可以产生优秀的后代。什么情况？
回到题主的问题，同样的道理，远古人类近亲繁殖，能够生出后代，也越来越聪明。可以想象，如果人类走哈布斯堡家族的老路，可能早就灭亡了，所以这就不是智慧的问题了。
皇家公主
适者生存要理解这个问题，就不得不提到达尔文的“进化论”。进化论的核心思想是，适者生存，不能适应环境的物种，或者违背自然规律的物种，会像筛子一样被过滤掉。
如果理解了进化论的核心思想，也就能理解为什么古人即使近亲结婚也能生出健康聪明的后代。
为什么近亲不能结婚？会有什么后果？
亲属婚姻是最严重的后果。一方面是基因单一，缺乏基因融合。一旦个体基因发生变异，会对后代整体产生很大影响。
另一方面，两者都继承了同一个祖先的基因。一旦这个祖先的基因有缺陷，或者有隐性遗传病。那么两个人结合后，遗传缺陷和遗传疾病的风险会成倍增加，导致后代出现残疾或其他不健康的情况。
但是近亲结婚不是出生的后代，所以会有缺陷，但是有一定的概率。如果这两个人的共同祖先是健康的，他们的基因没有缺陷，那么后代不健康的风险会进一步降低。根据目前的遗传学研究，人类现在共享一个Y染色体祖先和一个线粒体祖母。
所以，近亲结婚可能不会出问题，但是出问题的概率更大。
以沙特王室为例。他们的近亲都嫁给了健康漂亮的后代吗？我不这么认为！他们只是想让你看看。他们想让你看看。这句话怎么解释？
如果沙特王室出生的孩子有生理缺陷或者智障，那么沙特王室肯定会把这些有缺陷的孩子藏起来，不让他们出现在公众面前。那些健康美丽的后代总会出现在公众面前。
同理，在古代，近亲结婚，也会有智力缺陷或者身体缺陷的孩子。根据进化的规律，在食物匮乏的古代，这些孩子在成长的过程中会被淘汰，到不了成年，更谈不上基因的延续。
留下来的必须是智力正常的健康孩子。这些孩子有机会成长，是现代人类的祖先。
它就像一个过滤器。在这个过程中，有些部落会因为隐性基因缺陷而被慢慢淘汰，就像哈布斯堡家族一样，而健全的基因会慢慢延续。
当然，古人类的基因并不总是在内部延续，他们也通过掠夺和争斗与其他部落的基因融合。欧洲人有尼安德特人的基因。
所以古人的近亲繁殖延续到现在的人类，在进化的过程中，筛选出一批遗传缺陷。有的基因是健全的，可以靠自身基因的力量延续，有的可以和外界基因融合。
