因为琼州海峡的地理位置和恶劣的天气条件，这里不允许造桥。由于其独特的地理位置，该海峡位于地震带上。如果发生大地震，桥梁结构将受到严重破坏。况且海峡气候复杂多样，风浪大，水流快，经常遭受台风袭击。
琼州海峡两岸港湾众多，有红堪湾、海安湾、埔前湾、海口湾、澄迈湾等。
琼州海峡是海南岛与大陆和东南亚国家海上交通和友好交往的通道。
