玉门关位于甘肃省敦煌市西北的潘晓芳市。玉门关遗址位于河西走廊最西端疏勒河南岸,东南距敦煌市约90公里,西距罗布泊东缘约150公里,周围是戈壁、沙漠和草甸。
玉门关位于敦煌市西北80公里的戈壁滩上。场地范围东起仓亭坊,西至方先明,南至三墩。
玉门关是地理区域上东西交通分界的标志,自古以来就是东西交通的重要通道。