东莞站位于石龙，位于东莞市石龙镇西湖社区西湖路。火车站东北侧是石龙镇，西南侧是茶山镇。站前有一个广场，两边有相应的公交车站。行人可通过站前地下隧道穿越车站，往返于石龙、茶山不同方向的公交车站。
东莞火车站是一座紧凑的地面火车站，楼层较低，其中地面建筑是站房的主体部分，地铁站厅和站台位于地下两层。两个站前广场分布在站房的西南侧和东北侧，分别面向石龙镇和茶山镇。
东莞火车站的建成，解决了石龙火车站规模过小无法适应更大客流的问题，实现了石龙镇火车站客货分线的功能，不仅方便了广大市民，也为铁路沿线区域经济发展带来了机遇。
