外科口罩和医用口罩的主要区别在于过滤效果、鼻夹松紧程度和生产标准。外科口罩的过滤率比较高，鼻夹比较紧。采用YY0649-2011的生产标准。医用一般指一次性医用口罩或护理口罩，采用YY/T0969-2011的生产标准。
过滤效果不同是外科口罩和医用口罩的区别之一。一般来说，外科口罩需要较高的颗粒物过滤率，相对较高，其过滤材料需要经过严格检测才能使用，而医用口罩对颗粒物过滤率的要求相对较低。
外科口罩和医用口罩的区别在于鼻夹的松紧程度。虽然医用口罩上面会有鼻夹，但是鼻夹并不是很贴脸，所以用这个口罩可以呼吸更顺畅。不过外科口罩的鼻夹相对来说跟脸比较紧，戴久了也不会松脱。
外科口罩和医用口罩的生产标准也不一样。外科口罩采用YY0649-2011的生产标准，全称为医用外科口罩。医用口罩采用YY/T0969-2011的生产标准。这种口罩指的是一次性医用口罩或医疗保健口罩，前者在生产标准上更为严格。
